截至2022年底止，馆藏档案共有全宗210个，馆藏量达119763卷，其中民国档案3111卷，会计档案28697卷。馆藏共有382602件档案，其中纸质照片档案7929张，数码照片850张，音视频1882个，实物档案232个。图书资料21139册。特色档案有民国档案、红色档案、黄帝文化、非遗档案、宗谱等，涵盖了从清代到当前有关缙云政治、经济、文化、史志、风土民情等多方面内容。家谱档案馆藏量在全省位居前列。